法律分析：保险公司拒绝赔偿应当有合理依据，先天性疾病是否属于保险责任应当根据保险合同约定来确定。如果保险合同中未对此作出明确规定，应当根据保险合同的约定及相关法律法规进行分析判断。
法律依据：
1.《合同法》第一百一十三条：当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担违约责任。
2.《保险法》第六十八条：保险人应当按照保险合同约定履行给付保险金等义务。
3.《中华人民共和国民法典》第十二条：法律有规定的，依照其规定；没有规定的，参照通行的社会习惯和公平原则。
综上所述，当保险公司拒绝赔偿先天性疾病时，应当在保险合同约定范围内进行判断，如果保险合同未作出明确规定，应当参照通行的社会习惯和公平原则进行分析判断。如果保险公司无合理依据拒绝赔偿，被保险人可以通过法律手段维护自己的合法权益。
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