第四章 图谱的编辑与输出
Vector NTI主程序中的图谱窗口有内建作图和图形编辑功能,我们可以依照自身的需求进行绘图,图形可以进行输出成为个人的美术作品。 将光标点击图谱窗口之后可以见到下列指令:
这些指令中有一些和
上一章序列窗口有类似的功能,在此便不加以重述。视图谱大小和形状:
可以检
能够改变图形的形状,把序列变成圆形或是直线,
圆形的图形适用于表现质体序列的形状;直线适用于表现单一股序列形状。图谱大小用
来放大缩小图片,可以依照个人喜好调整。
图谱被程序标上限制酶的切位必须要移除。在上方Analysis→Restriction Analysis→Restriction sites中点选Remove ALL再按OK就可以了。接着就可开始编辑图形了。我们要在序列标示特定标记时,先将光标移至图谱窗口,接着按下
指令会出现图4.1:
图4.1 编辑图形设定
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在窗口中左边是程序已经内建好的图形,每一个图形代表着序列种种不同的生物功能;右边我们可以编辑图形的范围和命名,设定好以后按OK就可以了。
图4.2 选择所要编辑的图形
接着编辑的图形就会出现在图谱窗口:
图4.3 选择斑马鱼海大基因,所出现的图形画面
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第四章 图谱的编辑与输出
若要修改内建的图形显示方式,可以点选进行设定:
按钮(图4.4),针对个人喜好
图4.4 Graphics Display Setup,为修改图形显示的工具
按下OK就可已更改为欲设定的图形(图4.5):
图4.5 修改后的结果
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关于图形的大小和文字的更变,我们可以按住Ctrl后按下可以调整图形和文字(图4.6):
图4.6 调整图形的大小及文字的变更
按钮,接着就
我们还可以更进一步进行完整的编辑,按下何的图形或文字进行编辑(图4.7):
图4.7 更进一步的对图形进行编辑
按钮可以点选图谱窗口中任
点选图形或文本块后可以进行上下拖移和改变形状的功能;按下鼠标右键可以更改格式,点选Properties后可选择许多不同表示方法(图4.8):
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第四章 图谱的编辑与输出
图4.8 点选Properties进行格式的编辑
按下确定就可以完成编辑(图4.9)。
图4.9 利用Properties进行编辑后的结果
如果是在文本块下按鼠标右键,并点选Properties可以进行对文字的编辑(图4.10):
图4.10 利用Properties进行文字的编辑
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按下确定就可以完成编辑(图4.11)。
图4.11 Properties文字编辑的结果
在最旁边有个回形针的按钮(图4.12),点选之后可以输入相关的文字作为批注。所输入的文字也可以进行相关的调整:
图4.12 为图形增加文字批注
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第四章 图谱的编辑与输出
按下OK就会显示在图谱窗口上(图4.13),所输入的文字批注也会在文字窗口中出现。
图4.13 图形的批注结果
NOTE:想要删除图形或是文字的话可以点选欲删除的区块,按下鼠标右键或是进入Edit内选择Delete Feature Form FMap,再按确定就可以了。
图形的输出:在画好图片后,要如何从Vector NTI中输出呢?我们只要执行指令(图4.14)就可以将图形复制,操作方式同上一章所述。
图4.14 将编辑好的图形输出
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图形输出后可以进行再编辑,以复制到PowerPoint为例子(图4.15),输出的图形为群组图案,我们只要取消群组图案后就可以编辑图形和文字了。
图4.15 输出到PowerPoint的图形结果
如此一来我们就有一张漂亮的序列图形,可以应用在报告或论文写作上了。
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