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DNA提取各种缓冲液的配制

来源:小奈知识网
植物总DNA的提取之迟辟智美创作

一、所需仪器设备及消耗品

剪刀、塑料袋(封口)、冰箱、棕色广口瓶(1000、500、200、100、50ml)、量筒(1000、500、100、

10ml)、烧杯(1000、500、200、100ml)、pH试纸、电子天平、高压灭菌锅、研钵、液氮罐(液氮)、水浴锅、离心机、移液器(1套)、枪头(1ml、200ml、20μl)、枪头盒、离心管(1.5ml)(包括盒和架)、一次性手套、电泳仪、电泳槽、塑料胶带(宽)、微波炉、凝胶成像系统、垃圾桶、冰盒(自制)、记号笔、单面刀片 二、所需化学药品及试剂

CTAB、NaCl、EDTA-Na2·2H2O、Tris、冰乙酸、硼酸、β-巯基乙醇、NaAc、氯仿(三氯甲烷)、异戊醇、无水乙醇、溴酚蓝、琼脂糖、蔗糖、溴化乙锭(EB)、RNase、NaOH、HCl(浓)、ddH2O 三、各种缓冲液的配制

(一)2%CTAB提取缓冲液(300ml)(高压灭菌)

4mol/L的NaCl 35ml×3=105ml 1mol/L的Tris-HCl 10ml×3=30ml ×3=12ml

CTAB 2g×3=6g

(二)1×TE(母液pH8.0)(50ml)(高压灭菌)

1mol/L的Tris-HCl(pH8.0) 500μl 0.5mol/L的EDTA(pH8.0) 100μl 最后加ddH2O定容到 50ml

工作液为×TE(45ml灭菌的ddH2O中,加入5ml已

灭菌的1×TE)

(三)4mol/L的NaCl(150ml)(高压灭菌)

35.055g的NaCl,加ddH2O120ml溶解,再加水定容到150ml

(四)1mol/L的NaCl(400μl)(用于配制RNase贮存液) 取4mol/L的NaCl(已灭菌)100μl,加300μl灭菌的ddH2O.

(五)3mol/L的NaAc溶液(pH5.2)(50ml)(高压灭菌)

NaAc·3H2O

加ddH2O 30ml 加ddH2O定容到 50ml

(六)RNase贮存液(10mg/ml)(1ml)

1mol/L的Tris-HCl(pH7.5) 10μl 1mol/L的NaCl 15μl RNase 10mg 沸水浴15~20min

(七)EB贮存液(1mg/ml)

EB 30mg ddH2O 30ml

磁力搅拌至完全溶解,装入棕色瓶,铝箔包裹,保

管于室温.

μg/ml(30ml加15μl、40ml加20μl)

(八)10×TBE缓冲液(电泳缓冲液)(高压灭菌)

Tris碱 54g

0.5mol/L的EDTA(pH8.0) 20ml

以上溶于400ml的ddH2O中,在定容到500ml 工作液为1×TBE或×TBE

(九)6×上样缓冲液(4℃保管)

0.25%的溴酚蓝(2.5mg/1ml 40%(w/v)的蔗糖水溶

液)

40%(w/v)蔗糖水溶液(2g/5ml的ddH2O,加热溶

解,注:温度不能太高)

(十)1mol/L的HCl溶液(不用灭菌)

8.62 ml的浓盐酸,加灭菌ddH2O 91.38ml,混匀,室温保管(100ml).

(十一)5mol/L的NaOH溶液(50ml,10g的NaOH溶于50ml灭菌的ddH2O中)(不用灭菌)

200g的NaOH,溶于灭菌的ddH2O中,定容至

1000ml

(十二)1mol/L的Tris-HCl(pH8.0)(100ml)(高压灭菌)

80ml的ddH2O

加浓盐酸调节pH值至8.0(年夜约加4.2ml)

(十三)0.5mol/L的EDTA(pH8.0)(50ml)(高压灭菌)

2H2O 2·

1g的NaOH 磁力搅拌器剧烈搅拌 40ml的ddH2O

DNA定量用紫外分光光度计法,1OD260≈50μg/ml双链DNA.

PCR(聚合酶链反应)

一、所需仪器设备及消耗品

冰箱(4℃、20℃)、高压灭菌锅、离心机、移液器(1套)、枪头、枪头盒、PCR管(包括盒和架)、PCR仪、离心管(包括盒和架)、一次性手套、电泳仪、电泳槽、塑料胶带(宽)、微波炉、凝胶成像系统、垃圾桶、冰盒(自制)、记号笔、单面刀片

二、所需化学药品及试剂

质粒(阳性对比)、引物(1、2)、4×dNTP、DNA模板、buffer(MgCl2)、TaqDNA聚合酶、ddH2O、琼脂糖、DNA标准样品(DNA ladder)、溴化乙锭(EB)、5×TBE电泳缓冲液(Tris、硼酸、EDTA) 三、PCR反应体系与反应法式 仅供参考

成份 无离子水 缓冲液(buffer)

MgCl2 4×dNTP

母液浓度

10× 25mmol/L 2mmol/L

各成份加入量(μl/20μl)

2 2

各成份终浓度 或含量

1× 1.5 mmol/L 0.2 mmol/L

引物 TaqDNA聚合酶 模板DNA

5pmol/L 5U/μl 20ng/μl

2

mol/L 3U 50ng

把持顺序:

①水、4×dNTP混合

② buffer、taqDNA聚合酶混合,①、②混合 ③ 加入引物

④混匀、分装PCR管

⑤向每个PCR管加入模板DNA

PCR扩增反应法式:

94℃预变性3~5min.

进入循环:94℃变性30s→56℃退火30~45s→72℃延伸1~2min,30~36个循环.

循环结束后再72℃延伸7min.

外源脱水应答转录因子DREB基因在转基因小麦中的诱导型表达与抗旱生理效果

Induced Expression of DREB Transcriptional Factor and Study on Its Physiological Effects of Drought Tolerance in Transgenic Wheat

成份 无离子水 缓冲液(buffer)

4×dNTP 引物1 引物2 TaqDNA聚合酶 模板DNA

母液浓度

10× 2mmol/L

5U/μl 20ng/μl

各成份加入量(μl/25μl)

13? 2 5? 5? 0.2? 1?

各成份终浓度 或含量

1× 0.2 mmol/L 1μmol/L? 1μmol/L?

1U 50ng

PCR扩增反应法式:

94℃预变性5min.

进入循环:94℃变性45s→45℃退火45s→72℃延伸1min,35个循环.

循环结束后再72℃延伸10min.

μmol/L,≥μmol/L时,特异性降低或形成引物二聚体,≤μmol/L时,降低产量.

PCR反应中每种dNTP的终浓度为20~200μmol/L.

所用引物浓度是5μmol/L吗?

PCR反应时,每个引物的终浓度是几多?4×dNTP的终浓度是几多?TaqDNA聚合酶的终浓度是几多?模板DNA的终浓度是几多?

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