不影响。因为配偶父母不属于政审对象。
军婚，是与现役军人形成婚姻关系的婚姻。军婚，受到国家法律重点保护，如果破坏现役军人的家庭婚姻关系，应受到刑法的严厉打击。
军婚不能离婚么？
军婚不是不能离婚。只是非军人一方提出离婚受到一定的限制。即非军人一方提出离婚的，应当征得军人同意，但是军人一方有重大过错的除外。且前述的重大过错主要是指重婚、与他人同居、实施家庭暴力等。
如果军人提出离婚，同意离婚，政治机关会同意出具离婚证明，如果女方一方不同意，政治机关会进行调解，调解无效，符合离婚条件是什么？的，出具离婚证明，并交由地方有关部门进行调解，调解无效的，由当事人到法院提起离婚诉讼。
综上所述，女方父亲有案底不影响与军人结婚，因为结婚是自由自愿的。
【本文所涉及的法律依据】：：
《中华人民共和国民法典》
第一千零四十六条结婚应当男女双方完全自愿，禁止任何一方对另一方加以强迫，禁止任何组织或者个人加以干涉。
第一千零四十九条要求结婚的男女双方应当亲自到婚姻登记机关申请结婚登记。符合本法规定的，予以登记，发给结婚证。完成结婚登记，即确立婚姻关系。未办理结婚登记的，应当补办登记。
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