法院查封小产权房后，被告仍能居住的。法院在民事诉讼中，根据原告的申请，依法采取保全措施，查封被告的小产权房或其它房产的，其目的在于防止被告转移资产，逃避法律责任。在房屋被查封期间，房屋产权人不能将该房屋进行买卖、抵押、过户、租赁等，但仍可以正常居住的。
【本文关联的相关法律依据】
《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》人民法院可以查封、扣押、冻结被执行人占有的动产、登记在被执行人名下的不动产、特定动产及其他财产权。未登记的建筑物和土地使用权，依据土地使用权的审批文件和其他相关证据确定权属。对于第三人占有的动产或者登记在第三人名下的不动产、特定动产及其他财产权，第三人书面确认该财产属于被执行人的，人民法院可以查封、扣押、冻结。小产权房能作为房产法院强制执行，但一般采取的是以物抵款的形式办理，不能拍卖。
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